Η έννοια του "Green Shipping" απαιτεί σημαντικές επενδύσεις στο μηχανοστάσιο και στα συστήματα διαχείρισης αποβλήτων του πλοίου. Αυτές οι εργασίες απαιτούν προηγμένο σχεδιασμό (engineering) και εξειδικευμένες εγκαταστάσεις κατά τη διάρκεια του δεξαμενισμού.
Τα πλοία χρησιμοποιούν θαλασσινό νερό ως έρμα για τη σταθερότητά τους. Η απόρριψη αυτού του νερού σε διαφορετικά οικοσυστήματα μεταφέρει χωροκατακτητικούς μικροοργανισμούς που καταστρέφουν την τοπική χλωρίδα και πανίδα.
Η Λύση: Η εγκατάσταση συστημάτων Ballast Water Treatment Systems (BWTS) χρησιμοποιεί υπεριώδη ακτινοβολία (UV), χλωρίωση ή ηλεκτρόλυση για να εξουδετερώσει τους μικροοργανισμούς πριν το νερό απορριφθεί πίσω στη θάλασσα.
Η μετασκευή αυτή απαιτεί πολύπλοκες σωληνώσεις και ηλεκτρολογικές συνδέσεις σε συχνά περιορισμένους χώρους του μηχανοστασίου.
Για να μειωθούν οι εκπομπές οξειδίων του θείου (SOx), πολλά πλοία επιλέγουν την εγκατάσταση scrubbers. Αυτά τα γιγαντιαία συστήματα τοποθετούνται στην καμινάδα του πλοίου και "πλένουν" τα καυσαέρια χρησιμοποιώντας θαλασσινό νερό, αφαιρώντας τα επιβλαβή σωματίδια πριν απελευθερωθούν στην ατμόσφαιρα.